Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SEC23BQ15437 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SEC23BQ15437 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SEC23BQ15437 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SEC23BQ15437 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SEC23BQ15437 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SEC23BQ15437 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SEC23BQ15437 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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