Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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