Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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