Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGB1Q14028 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms