Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
APOFQ13790 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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APOFQ13790 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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APOFQ13790 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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APOFQ13790 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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APOFQ13790 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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