Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALCAMQ13740 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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