Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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HDAC1Q13547 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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