Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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SP140Q13342 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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SP140Q13342 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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SP140Q13342 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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SP140Q13342 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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SP140Q13342 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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SP140Q13342 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SP140Q13342 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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