Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TRIM28Q13263 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms