Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PPFIA1Q13136 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PPFIA1Q13136 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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