Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NR1H3Q13133 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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