Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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