Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
MRPL28Q13084 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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