Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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