Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNEQ04844 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms