Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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PTPRDP23468 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRDP23468 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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