Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRHP20396 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRHP20396 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRHP20396 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRHP20396 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRHP20396 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRHP20396 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRHP20396 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRHP20396 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRHP20396 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRHP20396 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRHP20396 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRHP20396 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRHP20396 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
TRHP20396 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
TRHP20396 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRHP20396 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRHP20396 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRHP20396 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRHP20396 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRHP20396 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRHP20396 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRHP20396 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
TRHP20396 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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