Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
J3KRW8 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
J3KRW8 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
J3KRW8 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
J3KRW8 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
J3KRW8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
J3KRW8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
J3KRW8 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
J3KRW8 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
J3KRW8 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms