Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms