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| PTPRQ | Q9UMZ3 | MTCO1P57-201 | ENST00000432182 | 261 nt | BASIC | 0.12 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | AL590502.1-201 | ENST00000433019 | 505 nt | TSL 2 BASIC | 0.12 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | MTND2P24-201 | ENST00000453434 | 806 nt | BASIC | 0.12 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | AC079943.2-201 | ENST00000488999 | 716 nt | TSL 3 BASIC | 0.12 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | Y_RNA.654-201 | ENST00000497848 | 106 nt | BASIC | 0.12 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | PDCD5P2-201 | ENST00000507570 | 312 nt | BASIC | 0.12 | □□□□□ -2.39 | | |
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| PTPRQ | Q9UMZ3 | AC245047.7-201 | ENST00000440265 | 293 nt | BASIC | 0.12 | □□□□□ -2.39 | | |
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| PTPRQ | Q9UMZ3 | BX284668.6-201 | ENST00000606899 | 438 nt | BASIC | 0.11 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | AC080188.3-201 | ENST00000624842 | 748 nt | BASIC | 0.11 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | RGS13-204 | ENST00000543215 | 1518 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 0.11 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | RNU6-1010P-201 | ENST00000362757 | 107 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | Y_RNA.332-201 | ENST00000365271 | 113 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | RNU6-359P-201 | ENST00000365466 | 108 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
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| PTPRQ | Q9UMZ3 | NDUFB4P10-201 | ENST00000452541 | 359 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
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| PTPRQ | Q9UMZ3 | DPY19L1-208 | ENST00000612226 | 607 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
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| PTPRQ | Q9UMZ3 | MTND1P21-201 | ENST00000412991 | 285 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
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| PTPRQ | Q9UMZ3 | AC092423.1-201 | ENST00000430165 | 186 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
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| PTPRQ | Q9UMZ3 | RPS29P8-201 | ENST00000445109 | 171 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | AC012308.1-201 | ENST00000451232 | 178 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | AC126177.2-201 | ENST00000552154 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | MIR4645-201 | ENST00000583158 | 77 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | BNIP3P30-201 | ENST00000601184 | 574 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | AL513534.2-201 | ENST00000603836 | 250 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | AC092106.3-201 | ENST00000611308 | 722 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | AC130324.3-201 | ENST00000614165 | 542 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | MIR8063-201 | ENST00000621930 | 81 nt | BASIC | 0.1 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | C9orf84-203 | ENST00000374287 | 4721 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 0.09 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | Y_RNA.35-201 | ENST00000362601 | 101 nt | BASIC | 0.09 | □□□□□ -2.39 | | |
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| PTPRQ | Q9UMZ3 | DIAPH3-AS1-201 | ENST00000422052 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 0.09 | □□□□□ -2.39 | | |
| PTPRQ | Q9UMZ3 | LINC02336-201 | ENST00000434117 | 330 nt | TSL 3 BASIC | 0.09 | □□□□□ -2.39 | | |