Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CITED1Q99966 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms