Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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