Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
Q1T7F1 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Q1T7F1 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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