Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GEN1Q17RS7 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GEN1Q17RS7 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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