Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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VAMP3Q15836 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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VAMP3Q15836 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
VAMP3Q15836 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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