Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms