Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NPTX1Q15818 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms