Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
IRF4Q15306 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
IRF4Q15306 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.3 ms