Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRKQ15262 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRKQ15262 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms