Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERPUD1Q15011 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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