Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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RAB39AQ14964 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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RAB39AQ14964 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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RAB39AQ14964 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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RAB39AQ14964 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RAB39AQ14964 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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RAB39AQ14964 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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RAB39AQ14964 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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RAB39AQ14964 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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RAB39AQ14964 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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RAB39AQ14964 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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RAB39AQ14964 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
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RAB39AQ14964 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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RAB39AQ14964 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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RAB39AQ14964 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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RAB39AQ14964 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RAB39AQ14964 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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