Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMC1AQ14683 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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