Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SQLEQ14534 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SQLEQ14534 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms