Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms