Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SPTAN1Q13813 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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