Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1SQ13698 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1SQ13698 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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