Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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