Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ATRQ13535 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATRQ13535 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
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