Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCIRG1Q13488 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms