Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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