Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
AP3B2Q13367 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
AP3B2Q13367 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms