Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KLF1Q13351 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms