Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SP140Q13342 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
SP140Q13342 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SP140Q13342 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SP140Q13342 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms