Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSTF3Q12996 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSTF3Q12996 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CSTF3Q12996 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSTF3Q12996 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSTF3Q12996 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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