Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TROQ12816 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TROQ12816 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TROQ12816 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TROQ12816 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TROQ12816 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TROQ12816 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TROQ12816 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms