Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TROAPQ12815 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms