Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
LRRTM2O43300 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LRRTM2O43300 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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