Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SNX13Q9Y5W8 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SNX13Q9Y5W8 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SNX13Q9Y5W8 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SNX13Q9Y5W8 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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