Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SHOC2Q9UQ13 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SHOC2Q9UQ13 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms