Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LRRIQ1Q96JM4 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms